Главные элементы анаэробных установок — герметичные емкости. Обычно они размещаются под землей. Они устроены сложнее, чем аэротенки, а строительство требует значительных расходов и энергии. Установки могут быть одно- или двухступенчатыми, включать различные виды реакторов.
В двухступенчатой системе первая емкость — это биоустановка непрерывного действия с постоянным перемешиванием содержимого. Вторая — резервуар для выделения и концентрации твердых частиц (может быть отстойником или центрифугой).
Часть осадка из второго резервуара возвращают в первый для повышения и стабилизации концентрацию биологически активной микрофлоры.
Выделение газа затрудняет отстаивание, поэтому для использования стандартных отстойников на второй ступени необходимо предварительно удалить газ из потока, поступающего из первой ступени. Поэтому такие системы применяют для поэтапного разделения процессов и: сначала получают летучие органические кислоты, а затем проводят метановое брожение.
В комплексах анаэробной обработки, которые используются в промышленности, выделяют:
- Отстойники (лагуны и пруды) — могут монтироваться на открытом воздухе или в помещениях. В регионах с теплым климатом служат еще и источником биогаза для топливных систем производства. Такие объекты чаще строят рядом с комплексами по выращиванию мясного и молочного скота, а также предприятиями по производству разных напитков, фармацевтических товаров, косметики.
- Метантенки — крупногабаритные резервуары для сбраживания осадка и получения биогаза. Наиболее распространены модели, работающие как реакторы с полным перемешиванием. Бывают открытыми или закрытыми, с жестким или плавающим перекрытием. Стандартный метантенк имеет полезный объем 1000–3000 м³.
- Биореакторы — современные устройства, конструкция которых позволяет удерживать биомассу в реакционном пространстве. Они экономичны, так как не требуют строгого управления условиями среды и длительного формирования популяции анаэробов.
Для автономных канализационных систем в частных домах применяют компактные аппараты для очистки сбрасываемой жидкости от загрязняющих веществ. Большой популярностью пользуются компактные анаэробные септики, не требующие большой площади.